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近1年魏泓团队爆发:17文+9通讯+2 Science+IF 180 !

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今天是第708期日报。



今天的日报一共有17篇文章,我们特别编发魏泓教授第三军医大学基础部实验动物学教研室教授、博士生导师,中国科学院微生物所、重庆畜牧科学院兼职研究员)和团队自2017年至今发表的SCI论文集合。


魏泓教授是第三军医大学实验动物学科的创立者,他和团队所建立的实验动物平台,有两张王牌:其一,国内规模大、技术体系稳定、服务单位多、最具影响力的无菌动物平台;其二,小型猪遗传工程技术体系,是国内率先开展巴马香猪在疾病模型、生物材料、药物评价的应用研究的实验平台。


经过不懈努力,魏泓教授创立的平台已经开始稳定、大批量产生科研成果,自2017年至今,该平台就已发表17篇SCI论文(累积影响因子179.703),其中以通讯作者(含并列)发表9篇,影响因子5分以上的有4篇,影响因子10分以上的有2篇(IF分别为18.392、13.164);参与发表论文8篇,其中10分以上的有4篇(Science2篇、Nature Communications1篇、J Pineal Res1篇)。


这是厚积薄发的结果,在中国实验动物领域,魏泓教授和团队无疑已成为核心力量之一。


今天我们特别编发魏泓教授和团队近1年多来的成果,想必会带给你很大启发!


我们需要特别提醒你的是,魏泓教授是2018中国肠道大会的主席之一,除了大会的整体组织工作,他还特别牵头组织5月12-13日举行的“中国动物肠道大会”


中国动物肠道大会

点击图标可了解详情


他还会在5月11日晚现身第四期“肠·道”演讲,为观众分享实验动物的前世今生故事。


如果你想跟魏泓教授探讨实验动物模型的合作,或者近距离向他请教,记得5月要到北京国家会议中心参加中国肠道大会哈!


点击图片可了解最新进展


5月11-13日,据说有远见的导师们、老板们都会安排学生们、员工们到北京,在中国肠道大会听干货涨知识~~~ 请注意,第一波早鸟优惠和大会征文会在4月15日截止,详情请访问官网了解:2018.mr-gut.cn。


下面是魏泓教授和团队的研究成果分享:


通讯作者文章

Gastroenterology:大肠癌患者的粪便让小鼠有长癌倾向

Gastroenterology[IF:18.392]

① 普通及无菌小鼠灌喂结肠直肠癌(CRC)患者或健康人的粪便,普通小鼠经氧化偶氮甲烷处理诱导结肠瘤形成;② CRC组普通小鼠发展出高度不典型增生和肉眼息肉的比例显著升高,CRC组的无菌小鼠细胞增殖多,两种小鼠的粪便菌群丰度均下降且菌群组成发生变化;③ 两种小鼠的小肠组织中调控炎症的细胞因子表达升高(包括CXCR1/2、IL-17A、IL-22、IL-23A),Th1和Th17细胞比例增加;④ 参与细胞增殖、多能性、凋亡、血管新生、浸润和转移的基因上调。

Gavage of Fecal Samples From Patients with Colorectal Cancer Promotes Intestinal Carcinogenesis in Germ-free and Conventional Mice

2017-08-17  DOI: 10.1053/j.gastro.2017.08.022

Blood:用巴马香猪模型研究甲状腺轴调控造血的机制

Blood[IF:13.164]

① 用ENU诱变构建重度先天性甲状腺功能减退症伴随贫血和T淋巴细胞减少症的巴马香猪模型,模拟甲减患者的临床特征;② 鉴定出双氧化酶2(DUOX2)的新型隐性c.1226A>G转换是主效突变位点(p.D409G),该突变阻碍过氧化氢的产生,致甲状腺激素(TH)合成失败;③ 胸腺转录组测序分析揭示,该突变引起KLF9显著下调;④ TH对KLF9的直接调控依赖于TH受体(TR),在斑马鱼胚胎中敲除klf9,影响造血发育如红细胞成熟和T细胞生成。

Thyroid hormone regulates hematopoiesis via the TR-KLF9 axis

2017-11-16  DOI: 10.1182/blood-2017-05-783043

eLife:利用ENU诱变建立突变猪模型

eLife[IF:7.725]

① N-乙基-N-亚硝基脲(ENU)诱变可用于在果蝇、斑马鱼、小鼠的全基因组水平上发现具有新功能的基因,但缺乏大型模式动物上的应用;② 通过系统性的3代ENU诱变,建立了具有不同形状的36个显性突变及91个隐性突变的猪模型;③ 例如,SOX10基因的R109W突变可造成猪的内耳功能障碍,可模拟人类的蒙底尼畸形,而FBXO32的表达上调与先天性八字腿相关;④ 利用ENU诱变产生的猪模型可促进农业生产及生物医药的研究。

Pilot study of large-scale production of mutant pigs by ENU mutagenesis

2017-06-22  DOI: 10.7554/eLife.26248

GigaScience:首个中国大鲵编码基因参考文库

GigaScience[IF:6.871]

① 通过构建高质量编码基因数据库,助力中国大鲵研究;② 对成年娃娃鱼的24个组织进行转录组测序,共得到93366个非冗余转录片段,平均长度为1326bp;③ 首次开发了用于构建高质量中国大鲵参考基因集的高效数据处理管道,并获得了26135个编码基因序列;④ 质量评估软件BUSCO及同源性分析结果显示,构建的基因集涵盖了脊椎动物通用单拷贝中70.6%的同源序列;⑤ 与西藏青蛙蛋白组数据库质量相当的情况下,新构建的转录基因集对编码序列的覆盖度更高。

A reference gene set construction using RNA-seq of multiple tissues of Chinese giant salamander, Andrias davidianus

2017-03-01  DOI: 10.1093/gigascience/gix006

TP:“抑郁”菌群或可改变肝脏代谢

Translational Psychiatry[IF:4.73]

① 将重度抑郁症(MDD)患者或健康个体的粪菌移植给小鼠,行为测验表明MDD小鼠可作为抑郁症模型;② 用多种方法分析菌群对肝脏代谢组的影响,发现MDD小鼠有191种代谢物水平发生变化(106种降低,85种升高),与脂质和能量代谢、氧化应激有关;③ 结合另一种抑郁症小鼠的蛋白质组分析,表明MDD发病机理可能涉及肝脏代谢改变;④ 对MDD小鼠多部位样本的代谢物进行综合分析,氨酰tRNA生物合成在MDD小鼠中显著改变,粪便中的代谢物与肝脏的最相关。

Metabolite identification in fecal microbiota transplantation mouse livers and combined proteomics with chronic unpredictive mild stress mouse livers

01-31  DOI: 10.1038/s41398-017-0078-2

HG:ENU诱变建立2A型瓦登伯革氏症候群的猪模型

Human Genetics[IF:4.637]

① 2A型瓦登伯革氏症候群(WS2A)是一种由小眼球相关转录因子基因(MITF)突变造成的听觉损失(HL)综合征,WS2A可隐性遗传;② 通过ENU诱变,建立MITF基因的DNA结构域产生L247S突变的微型猪模型;③ MITF基因的杂合突变猪表现出HL,皮肤、毛发、虹膜处的色素减退,并伴随着血管纹退化、蜗管内静息电位缺失等症状;④ MITF基因纯合突变猪及CRISPR/Cas9介导的MITF双敲除猪均表现出无眼畸形;⑤ MITF突变猪可模拟WS2A患者的临床症状及分子病理学。

Creation of miniature pig model of human Waardenburg syndrome type 2A by ENU mutagenesis

2017-11-01  DOI: 10.1007/s00439-017-1851-2

FCIM:同样压力条件下,无菌小鼠焦虑较弱

Frontiers in cellular and infection microbiology[IF:4.3]

① 无菌小鼠及SPF小鼠分为4组,其中2组接受慢性束缚应激(CRS)处理;② 相同的CRS条件处理下,相比于SPF小鼠,无菌小鼠的焦虑样行为较轻,且下丘脑-垂体-肾上腺(HPA)轴中的CRH、ACTH、CORT及ALD水平较高,Nr3c2 mRNA水平下降;③ 无菌小鼠的激素及激素受体也与SPF小鼠存在显著差异;④ 肠道菌群造成的HPA轴失衡可能影响脑中的神经内分泌系统,造成焦虑样行为。

Microbiota Modulate Anxiety-like Behavior and Endocrine Abnormalities in Hypothalamic-Pituitary-Adrenal Axis

2017-11-30  DOI: 10.3389/fcimb.2017.00489

BBR: 肠道菌群或影响大脑海马体功能

Behavioural Brain Research[IF:3.002]

① 与无特定病原体(SPF)小鼠相比,无菌(GF)小鼠在行为学实验中表现出抗焦虑特征,指示肠道菌群的缺失可以抑制焦虑;② 移植SPF小鼠的肠道菌群,不改变青年期GF小鼠的抗焦虑特征;③ 菌群移植可恢复GF小鼠海马体7种miRNA和139 种mRNA的表达水平,其中4种miRNA和21种对应的目标mRNA与疾病、特定生化功能相关;④ 表达量恢复的7种miRNA与糖代谢、脂代谢、分子联结、细胞结构相关性显著,改变最显著的是神经元轴突导向相关的生化通路。

Effects of gut microbiota on the microRNA and mRNA expression in the hippocampus of mice

2017-03-30  DOI: 10.1016/j.bbr.2017.01.021

JFS:绿茶多酚调节小鼠的菌群和脂代谢

Journal of Food Science[IF:1.815]

① 绿茶多酚(TP)低、中、高(0.05%、0.2%、0.8%)剂量组均可显著降低高脂饲料诱导的人源菌群(HFA)小鼠血清总胆固醇、甘油三酯、低密度脂蛋白、葡萄糖和胰岛素水平,且呈剂量依赖性;② TP显著增加HFA小鼠中的乙酸和丁酸水平;③ 其中低、中剂量组结肠菌群的丰富度和多样性显着增加;④ 逆转厚壁菌门/拟杆菌门的比值升高(中剂量最优);⑤ 中、高剂量组显著降低梭菌属丰度,提高拟杆菌属丰度,低剂量组显著提高turicibacter和毛螺菌属丰度。

Green Tea Polyphenols Modulate Colonic Microbiota Diversity and Lipid Metabolism in High-Fat Diet Treated HFA Mice

02-10  DOI: 10.1111/1750-3841.14058


非通讯作者文章

Science:膳食纤维治疗2型糖尿病,多亏关键肠道菌

Science[IF:37.205]

① 2型糖尿病患者随机分成两组,均用阿卡波糖治疗,U组(16例)为常规治疗组,W组(27例)接受同等热量的高膳食纤维营养干预;② 相比U组,W组的糖化血红蛋白等指标改善得更快更好,该临床效果可经粪菌移植在小鼠中重现;③ 治疗过程中患者肠道菌群结构改变,高膳食纤维富集了由15株乙酸和丁酸产生菌组成的功能群,抑制了吲哚和硫化氢产生菌;④ 这组菌尤其增加丁酸生成,促进GLP-1和PYY分泌改善血糖,其丰度和多样性与临床治疗效果显著相关。

Gut bacteria selectively promoted by dietary fibers alleviate type 2 diabetes

03-09  DOI: 10.1126/science.aao5774

Science:清除猪体内的PERV,为异种器官移植铺路

Science[IF:37.205]

① 体外实验中,猪内源性逆转录病毒(PERV)可感染人细胞,并在人细胞之间水平传播;② 联合采用CRISPR-Cas9、凋亡抑制剂和生长因子,制备PERV全部失活的猪原代细胞株,通过体细胞核移植,制备PERV失活的猪胚、胎猪和活猪;③ 证实PERV失活预防跨物种病毒传染的价值,成功制备PERV失活的动物,解决了异种器官移植的临床安全性问题;④ 用p53抑制剂处理,可减轻基因组工程多步骤过程的多重DNA损伤应激,支持PERV失活细胞的克隆扩增。

Inactivation of porcine endogenous retrovirus in pigs using CRISPR-Cas9

2017-09-22  DOI: 10.1126/science.aan4187

Nature子刊:NLRP3炎性小体突变,菌群与Treg联合确保肠道稳态

Nature Communications[IF:12.124]

① 携带NLRP3炎性小体突变的Cryopyrin相关周期性综合征(CAPS)患者的皮肤、关节和眼睛中有自身免疫性炎症,但肠道中没有;② 携带Nlrp3 R258W突变的CAPS模型小鼠的肠道维持内稳态,而且对实验性结肠炎和结直肠癌具有很强的抗性;③ Nlrp3 R258W突变通过重塑肠道菌群,诱导增加调节性T细胞(Treg)以提高抗炎能力,;④ Nlrp3 R258W突变仅在固有层单核吞噬细胞中直接增强IL-1β(而非IL-18)的分泌,进而增加局部抗菌肽促进菌群的重建。

Remodelling of the gut microbiota by hyperactive NLRP3 induces regulatory T cells to maintain homeostasis

2017-12-01  DOI: 10.1038/s41467-017-01917-2

JPR:褪黑素调节肠道菌群并缓解小鼠断奶压力

Journal of Pineal Research[IF:10.391]

① 断奶小鼠补充褪黑素后,体重增加显著提升,且肠道形态、隐窝深度、绒毛/隐窝比得到显著改善;② 褪黑素对肠道细胞的增殖或凋亡、Paneth细胞及杯状细胞的数量、回肠中肠上皮细胞相关标记物(蔗糖酶)及内分泌细胞相关标记物(嗜铬粒蛋白A、YY肽)表达影响较小;③ 补充褪黑素对血清氨基酸及压力相关参数的影响较小,增加肠道菌群的丰度,并增加乳杆菌属的丰度,显著改变肠道菌群的氨基酸及药物代谢;④ 肠道菌群可能介导了褪黑素的上述作用。

Melatonin alleviates weanling stress in mice: involvement of intestinal microbiota

2017-09-05  DOI: 10.1111/jpi.12448

FI:产肠道毒素大肠杆菌如何促进感染和菌群失衡?

Frontiers in Immunology[IF:6.429]

① 产肠道毒素的大肠杆菌(ETEC)感染诱导肠道IL-17的表达及肠道菌群的失调;② 并增加了能够产生γ-氨基丁酸的乳酸乳球菌的丰度;③ 在ETEC感染小鼠中使用抗生素,可降低肠道IL-17的表达,而γ-氨基丁酸或乳酸乳球菌可恢复肠道IL-17的表达;④ γ-氨基丁酸通过活化mTORC1-S6K1信号通路以提高肠道IL-17的表达。

Intestinal Microbiota-Derived GABA Mediates Interleukin-17 Expression during Enterotoxigenic Escherichia coli Infection

2017-01-16  DOI: 10.3389/fimmu.2016.00685

JI:Rip2在潘氏细胞溶菌酶分选中的作用

Journal of Immunology[IF:4.856]

① 潘氏细胞向肠腔内分泌大量抗微生物肽(包括溶菌酶),在维持肠道稳态中有重要作用;② 潘氏细胞中的溶菌酶分选需要Rip2,该过程依赖于Nod2、LRRK2和Rab2a;③ 潘氏细胞中,Rip2定位于致密核心囊泡(DCV),该定位需要肠道菌群的存在,且依赖于Nod2和LRRK2;④ 缺失Rip2的小鼠中,潘氏细胞中的溶菌酶被溶酶体降解,定位于致密核心囊泡(DCV)的Rab2a减少;⑤ 潘氏细胞中的溶菌酶分选,需要由Nod2-LRRK2-Rip2-Rab2a构成的基因通路。

Rip2 Is Required for Nod2-Mediated Lysozyme Sorting in Paneth Cells

2017-05-01  DOI: 10.4049/jimmunol.1601583

JGG:让巴马小香猪失去头尾黑毛色的基因突变

Journal of Genetics and Genomics[IF:4.051]

① 大部分巴马小香猪具有“两头乌”毛色模式,即头部和尾部为黑色,中部为白色;② 特定品系的野生型公猪和母猪交配后,产下2窝19只后代(F1),其中6只为突变猪,头尾仅有极小块黑斑;③ 两只突变F1猪交配后产下的F2代均为突变猪,可明确该突变为隐性遗传;④ 利用全基因组连锁分析和测序,明确突变原因为黑皮质素受体1(MC1R)基因的第67和68位之间被插入两个C碱基;⑤ 该突变引起一系列基因的表达、60天内的体重、部分血液和生化指标发生改变。

A 2-bp insertion (c.67_68insCC) in MC1R causes recessive white coat color in Bama miniature pigs

2017-04-20  DOI: 10.1016/j.jgg.2017.02.003

PLoS ONE:DNA修复和复制影响猪iPSC的传代稳定性

PLoS ONE[IF:2.806]

① 用多种小分子改善诱导条件,成功获得具有高多能性和分化能力、能形成嵌合体的猪诱导多能干细胞(iPSC);② 然而随着传代其多能性和分化能力不断下降,与Rex1表达水平降低相关;③ 与成纤维细胞相比,猪iPSC中,与WNT信号相关的基因表达上调,与MAPK信号和TGFβ通路相关的基因表达下调,但在传代过程中,这些基因表达情况异常;④ 参与DNA修复和复制的通路,在传代早期上调,随着传代下调;⑤ DNA修复和复制能力的削弱,与猪iPSC不稳定性相关。

DNA repair and replication links to pluripotency and differentiation capacity of pig iPS cells

2017-03-02  DOI: 10.1371/journal.pone.0173047

感谢本期日报的创作者:花开,沈志勋,小肠君,mildbreeze,药农,女巫,热心肠先生

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